国立的小学分为两种,即国民型小学与国民小学。国民型小学(马来语:Sekolah Jenis Kebangsaan)又分为国民型华文小学与国民型泰米尔文小学。这两种小学分别采用中文或泰米尔文为教学媒介语。除了英语之外,国民小学(马来语:Sekolah Kebangsaan)所有的科目都使用马来语为教学媒介语。马来西亚也有一些私立的小学,为数不多,但近几年呈现增长趋势。
中学(马来语:Sekolah Menengah)教育为期5年。国民中学(马来语:Sekolah Menengah Kebangsaan,简称国中或“SMK”)使用马来语为主要教学媒介语,但马来文以外的其他语言除外。除此之外,马来西亚还有81所国民型华文中学(马来语:Sekolah Menengah Jenis Kebangsaan,简称华中或“SMJK”),亦称改制中学。这类中学的学生大多数为国民型华小的毕业生,因此大部分学生来源为华裔。华中在办学上与国中存在差异,其中华中明文规定校长一职需由华裔出任,而大多数华中的每星期华文课节数皆位于160-200分钟。在一些华裔人口密度相对较高的地区,例如槟城,有些华中的每星期华文课节数甚至高达270-300分钟。相比之下,大多数国中皆没有教授华文课,如有则大多数安排在课余时间,选择报考华文的学生必须在放学后留堂上华文课。然而,少数华裔人数较多的国中会将华文课排入正课时间表内,但节数只有120-180分钟。在中三时,学生将报考初中检定考试(马来语:Penilaian Menengah Rendah,简称“PMR”)。不过,这项考试已在2014年废除,改为没有选填题的中三评估(马来语:Pentaksiran Tingkatan 3,简称“PT3”)。此项评估也于2020及2021年因新冠疫情而取消,2022年正式废除。此后中学生会在中五时参加马来西亚教育文凭(马来语:Sijil Pelajaran Malaysia,简称“SPM”)考试。这相当于先前英国殖民时代的普通或'O'级考试('O' level)。政府已决定放弃使用英语进行数理科教学,从2012年开始恢复为马来语,惟考试时学生仍可使用英文作答数理科试卷。。然而,仍有部分中学,包括所有国民型华文中学仍在中小学双语教学课程计划(“DLP”)下使用英语教导数理科。。